微卫星DNA（Microstatellite），又称简单重复序列(Simple Sequnce Repeat, SSR)，指DNA基因组中1-6个核苷酸的简单重复序列。在各种真核生物基因组中广泛存在，多数以2～6个碱基为核心单位、串联重复排列的序列。
应用领域：
◇ 遗传图谱构建 ◇ 种质鉴定 ◇ 遗传多样性分析 ◇ 基因定位 ◇ 数量性状基因座（QTL）分析
产品参数：
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测序平台及模式 |
Illumina MiSeq, PE250 |
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样本选择及数据量 |
1-5 个样，推荐1.0 Gb；
5-10 个样，推荐1.5 Gb；
10-20 个样，推荐2.0 Gb；
备注：不同样本分别提取DNA后等量混合建库 |
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DNA样本量 |
总量≥1.0 μg，浓度≥20 ng/μl
（总样本） |
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项目周期 |
标准分析36天 |
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交付指标 |
提供不少于100对引物（经过筛选后具有多态性的） |
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参考基因组 |
有参、无参均可
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技术线路：
信息分析内容
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序 号 |
分析项目 |
类 别 |
分 析 |
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1 |
下机数据统计 |
A |
√ |
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2 |
数据质控 |
A |
√ |
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3 |
高质量数据获取 |
A |
√ |
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4 |
SSRs搜索结果及统计 |
A |
√ |
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5 |
SSRs模体结果及统计 |
A |
√ |
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6 |
SSRs聚类及结果统计 |
A |
√ |
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7 |
SSRs多态性评估 |
A |
√ |
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8 |
SSRs引物设计 |
A |
√ |
A：标准信息分析 B：高级信息分析 C：个性化分析
分析结果展示
